學術單位
管理學院：
航運管理系暨研究所
資訊管理系
運籌管理系
海洋休閒管理系
海洋工程學院：
微電子工程系暨研究所
海洋環境工程系暨研究所
造船及海洋工程系暨研究所
電訊工程系
水圈學院：
漁業生產與管理系暨研究所
水產養殖系暨研究所
水產食品科學系暨研究所
海洋生物科技系暨研究所
海事學院：
輪機工程系暨研究所
航海科技系暨研究所
航運科技系
共同教育委員會
基礎教育中心
通識教育中心